El Departamento de Ingeniería en Computación realiza una activa labor en investigación, dedicándose a estudiar las aplicaciones de la disciplina y las tecnologías asociadas. En la actualidad ejecuta proyectos de investigación con financiamientos de la Universidad de Magallanes, de fuentes nacionales y de cooperación internacional. Los académicos del Departamento mantienen vínculos de colaboración permanente con investigadores chilenos y extranjeros, lo que se manifiesta en los artículos publicados como en las visitas de intercambio científico-cultural realizadas.